基因測(cè)序系統(tǒng)介紹

基因測(cè)序系統(tǒng)通過(guò)對(duì)DNA或RNA樣本進(jìn)行分析以識(shí)別其序列。它的應(yīng)用范圍非常廣泛，包括基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等領(lǐng)域。

高通量基因測(cè)序系統(tǒng)的主要參數(shù)包括：

1、**大產(chǎn)出：可生成**高120Gb數(shù)據(jù)，一次運(yùn)行可以完成10個(gè)轉(zhuǎn)錄組樣本測(cè)序?qū)嶒?yàn)。

2、測(cè)序芯片適配范圍：適配小于200M Reads片段標(biāo)簽序列的測(cè)序芯片。

3、數(shù)據(jù)讀長(zhǎng)：?jiǎn)味撕碗p端讀取序列均可達(dá)到150個(gè)堿基。

4、讀取精度：測(cè)序質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)為Q30，當(dāng)測(cè)序長(zhǎng)度為2x75bp時(shí)，80%以上的堿基數(shù)據(jù)質(zhì)量高于Q30；當(dāng)測(cè)序長(zhǎng)度為2x150bp時(shí)，75%以上堿基數(shù)據(jù)質(zhì)量高于Q30。

5、可讀取的連續(xù)單個(gè)重復(fù)堿基數(shù)量：可精確讀取≥12個(gè)的連續(xù)單個(gè)重復(fù)堿基（如AAAAAAAAAAAAAAAA）。

6、樣品用量：DNA起始量范圍為1ng-1ug。

7、自帶控制計(jì)算機(jī)：儀器自帶控制計(jì)算機(jī)整合到測(cè)序儀中，用于儀器控制、處理圖像和堿基檢出并能夠?qū)崟r(shí)進(jìn)行分析處理。

8、儀器運(yùn)行時(shí)間和數(shù)據(jù)產(chǎn)出：1 x 75 bp單端測(cè)序運(yùn)行12小時(shí)完成；2 x 75 bp雙端測(cè)序運(yùn)行18小時(shí)完成；2 x 150 bp雙端測(cè)序運(yùn)行30小時(shí)完成。**多可在30小時(shí)內(nèi)產(chǎn)生120G數(shù)據(jù)。

9、應(yīng)用范圍：可完成人類全基因組、單細(xì)胞測(cè)序、全外顯子組、微生物宏基因組、腫瘤大panel等大數(shù)據(jù)量檢測(cè)項(xiàng)目。

10、系統(tǒng)集成：測(cè)序系統(tǒng)主機(jī)內(nèi)置服務(wù)器，具備樣本文庫(kù)克隆擴(kuò)增、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析功能，無(wú)需額外配置樣本文庫(kù)克隆擴(kuò)增設(shè)備和服務(wù)器。

11、其他功能：支持基因測(cè)序和基因芯片掃描功能的結(jié)合，同時(shí)也是一個(gè)開(kāi)放平臺(tái)，可以兼容不同品牌建庫(kù)試劑。

12、耗材技術(shù)：具有RFID（無(wú)線電射頻識(shí)別）技術(shù)的耗材。

基因測(cè)序系統(tǒng)主要包括以下步驟：

1、準(zhǔn)備樣本，樣本可能來(lái)自生物體的各種組織，如血液、組織、細(xì)胞等。在測(cè)序之前，**須對(duì)樣本進(jìn)行預(yù)處理，以提取DNA或RNA。提取后，樣本需要進(jìn)行質(zhì)量控制和庫(kù)制備。

2、將樣本DNA或RNA轉(zhuǎn)換為測(cè)序庫(kù)。

3、測(cè)序，分為兩種主要方法：Sanger測(cè)序和高通量測(cè)序。 Sanger測(cè)序是一種傳統(tǒng)的測(cè)序技術(shù)，適用于小規(guī)模序列分析，如對(duì)單一基因的分析。高通量測(cè)序是一種高通量且成本低廉的技術(shù)，適用于大規(guī)模序列分析，如全基因組測(cè)序或轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。

4、測(cè)序后，進(jìn)行數(shù)據(jù)分析以識(shí)別和分析序列。